Để đảm bảo Dự án Tam Hiệp được tiến độ thuận lợi, Ban Chấp hành Trung ương Đảng và Hội đồng Nhà nước rất coi trọng việc xây dựng Dự án Tam Hiệp Vào tháng 1 năm 1993, Hội đồng Nhà nước đã thành lập Ủy ban Xây dựng Dự án Tam Hiệp của Hội đồng Nhà nước (gọi tắt là Ủy ban Xây dựng Dự án Tam Hiệp của Hội đồng Nhà nước) với tư cách là cơ quan ra quyết định cấp cao cho Dự án Tam Hiệp Ủy ban Xây dựng Tam Hiệp của Hội đồng Nhà nước do các thủ tướng hoặc phó thủ tướng kế nhiệm của Hội đồng Nhà nước làm chủ tịch và các thành viên của ủy ban là người đứng đầu các cơ quan liên quan trực thuộc Hội đồng Nhà nước, Chính phủ Nhân dân tỉnh Hồ Bắc và Chính phủ Nhân dân Thành phố Trùng Khánh, Ủy ban sông Dương Tử, Tập đoàn Tam Hiệp Trung Quốc và Tổng công ty Lưới điện Nhà nước Trung Quốc

Có một văn phòng trực thuộc Ủy ban Xây dựng Tam Hiệp của Hội đồng Nhà nước Là văn phòng hàng ngày của Ủy ban Xây dựng Tam Hiệp của Hội đồng Nhà nước, nó chủ yếu chịu trách nhiệm thực hiện các quyết định lớn của Ủy ban Xây dựng Tam Hiệp của Hội đồng Nhà nước và thực hiện các chức năng của chính phủ như tổ chức và điều phối, dịch vụ bảo lãnh, giám sát và kiểm tra trong quá trình xây dựng Dự án Tam Hiệp (bao gồm kiểm tra, nghiệm thu, vv)

Tổng công ty Phát triển Dự án Tam Hiệp Trung Quốc được thành lập (được đổi tên thành Tập đoàn Tam Hiệp Trung Quốc vào tháng 9 năm 2009, gọi tắt là Tập đoàn Tam Hiệp Trung Quốc) Với tư cách là pháp nhân dự án của Dự án Tam Hiệp, họ chịu trách nhiệm hoàn toàn về Dự án Tam Hiệp Việc xây dựng và vận hành dự án, huy động và sử dụng vốn cần thiết, trả nợ và vận hành sau khi hoàn thành trung tâm cũng chịu trách nhiệm huy động và trả nợ vốn cần thiết cho dự án tái định cư; Tập đoàn Lưới điện Nhà nước Trung Quốc chịu trách nhiệm xây dựng các dự án truyền tải và chuyển đổi điện cũng như quản lý và cấp kinh phí cần thiết cho các dự án kết nối xuyên khu vực Trong quá trình xây dựng Dự án Tam Hiệp, hệ thống quản lý xây dựng phù hợp với nền kinh tế thị trường xã hội chủ nghĩa đã được áp dụng và hệ thống quản lý xây dựng kỹ thuật được quốc tế chấp nhận bao gồm hệ thống đấu thầu và hợp đồng, hệ thống quản lý hợp đồng và hệ thống giám sát dự án tập trung vào hệ thống trách nhiệm của pháp nhân dự án đã được triển khai để đảm bảo chất lượng, kiểm soát tiến độ và đầu tư

Ủy ban Xây dựng Tam Hiệp của Hội đồng Nhà nước đã đặc biệt thành lập một nhóm chuyên gia kiểm tra chất lượng và thuê các chuyên gia có thẩm quyền như các học giả của Viện Hàn lâm Khoa học Trung Quốc và Viện Hàn lâm Kỹ thuật Trung Quốc để chịu trách nhiệm kiểm tra chất lượng toàn diện Dự án Tam Hiệp và giám sát chất lượng của Dự án Tam Hiệp từ cấp cao nhất

Công tác tái định cư tại Khu vực hồ chứa Tam Hiệp, dưới sự lãnh đạo của Ủy ban Xây dựng Tam Hiệp của Hội đồng Nhà nước, áp dụng hệ thống quản lý “sự lãnh đạo thống nhất của chính quyền trung ương, trách nhiệm của các tỉnh (đô thị) và quận”, thực hiện chính sách tái định cư phát triển, huy động các đối tác trong nước hỗ trợ Khu vực hồ chứa Tam Hiệp, do tỉnh Hồ Bắc, Thành phố Trùng Khánh và các quận (thành phố, huyện) trong Tam Hiệp tổ chức và thực hiện Khu vực hồ chứa thuộc thẩm quyền của mình theo nguyên tắc “chịu trách nhiệm kép về kinh phí và nhiệm vụ”

Đơn vị thiết kế của Dự án Tam Hiệp là Ủy ban sông Dương Tử, chịu trách nhiệm quy hoạch và thiết kế Dự án trung tâm Tam Hiệp và dự án tái định cư

Thực tiễn đã chứng minh rằng hệ thống xây dựng của Dự án Tam Hiệp đã làm thẳng thắn mối quan hệ giữa chính phủ, doanh nghiệp và thị trường, đồng thời mang lại sự bảo đảm về tổ chức, thể chế vững chắc nhất để Dự án Tam Hiệp được xây dựng như một dự án đẳng cấp thế giới

Trong quá trình tổ chức và xây dựng quốc gia, nó được thực hiện theo quy hoạch xây dựng Dự án Tam Hiệp đã được Đại hội nhân dân toàn quốc phê duyệt, mà chúng ta thường gọi là “phát triển cấp một, xây dựng một lần, trữ nước theo từng giai đoạn và tái định cư liên tục”

Phát triển cấp một: Phát triển cấp một sẽ được thực hiện trên đoạn từ Sandouping đến Trùng Khánh, thành phố Nghi Xương, tỉnh Hồ Bắc và không có dự án thủy lợi và thủy điện nào được xây dựng trên dòng chính của sông Dương Tử ở giữa

Hoàn thành cùng một lúc: Đập, trạm thủy điện, âu tàu và các công trình khác của Dự án Tam Hiệp đều được xây dựng cùng một lúc

Tích trữ nước theo từng giai đoạn: Hồ chứa nước Tam Hiệp sẽ được tích nước theo từng giai đoạn đến mức trữ nước thông thường là 175 mét Năm 2003, mực nước chứa cho phát điện trong giai đoạn đê ​​quai là 135 mét; năm 2006, mực nước vận hành ban đầu là 156 mét; năm 2008, bắt đầu xây dựng 175 mét bể chứa nước thử nghiệm; và đến tháng 10 năm 2010, mực nước dự trữ đạt mực nước bình thường là 175 mét

Tái định cư liên tục: Việc tái định cư khu vực hồ chứa Tam Hiệp được thực hiện liên tục theo từng giai đoạn, theo đợt, phù hợp với tiến độ của dự án trung tâm